Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms