Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms