Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRX1P78414 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRX1P78414 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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