Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAE1P78406 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAE1P78406 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAE1P78406 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAE1P78406 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAE1P78406 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAE1P78406 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAE1P78406 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAE1P78406 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAE1P78406 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms