Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPM4P67936 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPM4P67936 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms