Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms