Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms