Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms