Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms