Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms