Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms