Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPAP53621 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms