Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLCSP50747 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms