Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRE11P49959 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms