Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms