Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLD2P49005 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLD2P49005 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD2P49005 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLD2P49005 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLD2P49005 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD2P49005 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms