Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms