Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms