Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPOP42166 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms