Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYKP34925 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms