Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJB2P29033 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms