Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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