Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms