Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms