Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms