Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms