Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP4AP20648 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms