Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CCL3L1P16619 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CCL3L1P16619 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CCL3L1P16619 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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CCL3L1P16619 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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CCL3L1P16619 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CCL3L1P16619 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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CCL3L1P16619 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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