Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NME1P15531 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NME1P15531 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms