Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMP3P12645 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMP3P12645 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMP3P12645 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMP3P12645 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMP3P12645 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms