Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF3P11487 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF3P11487 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms