Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RARBP10826 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RARBP10826 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RARBP10826 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms