Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHGAP10645 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHGAP10645 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHGAP10645 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHGAP10645 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms