Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOP08100 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOP08100 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOP08100 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms