Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms