Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms