Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms