Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TIMM17BO60830 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms