Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF2O60811 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms