Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms