Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms