Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms