Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms