Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC78A2IDD5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms