Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms