Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms