Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms