Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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USP18Q9UMW8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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