Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms