Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRFN1Q9P244 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRFN1Q9P244 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRFN1Q9P244 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRFN1Q9P244 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRFN1Q9P244 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRFN1Q9P244 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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